גדר הפרדה היא מבנה פיזי המיועד להפריד בין שטחים או תחומים שונים, למשל בין מדינות, בין קהילות או בין תחומי פעולה שונים. הגדר יכולה להיות גדר חומה, גדר גבס או כל מבנה אחר המאפשר הפרדה בין שטחים.

שימושי הגדרות הפרדה יכולים להיות מגוונים. למשל, בהיבט הצבאי, גדרות הפרדה נעשות בין מדינות לצורך הגנה על גבולות המדינות מפני כוונות עוינות ותקיפות מבעד לגבולות. גדרות הפרדה עשויות להיות גם חלק מתהליך הרפובליקציה של מדינות, כך שהן משמשות להפרדה בין ממשלה וצבא לבין האזרחים.

בהיבט החברתי והפוליטי, גדרות הפרדה יכולות לשמש ככלי להפרדה בין קהילות שונות. למשל, בין יהודים לערבים במזרח התיכון או בין שלושת המינים בדרום אפריקה בתקופת האפרטהייד. גדרות הפרדה נעשות כדי להקל על ניהול מצבים קשים ולמנוע התנגשויות בין הקהילות, אך לעיתים גדרות הפרדה עשויות להימשך גם לאחר השגת הסכמים והתחשבות עם הצרכים של כל הקהילות השונות.